In zijn grootste avontuur ooit stoomt Thomas onontdekt gebied binnen! Als Thomas per ongeluk terecht komt in het langverloren dorp Groot Waterton, besluit de Dikke Controleur dat het dorpje opgeknapt moet worden om Sodor Dag te vieren. De nieuwe locomotief Stanley arriveert om te helpen met de bouwwerkzaamheden, en hij is erg groot en sterk. Stanley kan zo hard werken, dat Thomas een beetje bang is dat hij niet meer de Nummer 1 locomotief van Sodor zal zijn! Hij besluit een grapje uit te halen met Stanley, maar dat loopt helemaal in de soep. Thomas verdwaalt en is helemaal alleen, terwijl iedereen op het eiland hard naar hem op zoek is...