Pour échapper à leurs poursuivants, Dylan et Harper tentent de rendre l'Andromeda invisible, mais l'expérience tourne mal. Dylan disparaît et se retrouve projeté dans une réalité parallèle, où la chute n'a pas eu lieu. La République, complètement corrompue par l'Abysse, est aujourd'hui dirigée par Harper, tandis que Beka commande une faction rebelle...